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Quantification à haut débit des isoformes de l'épissage alternatif

 
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Ce projet est conduit au laboratoire de génomique fonctionnelle de l'Université de Sherbrooke (LGFUS). Le but global du projet est d'annoter et d'analyser les isoformes d'épissage des gènes reliés au cancer pour essayer de mieux comprendre les mécanismes de l'oncogenèse. Cette information a une valeur potentielle énorme étant donné que de nouveaux marqueurs pourront être identifiés pour le diagnostic du cancer, et de nouvelles cibles pourront être étudiées dans le cadre d'un programme de découverte de traitements. Une estimation rigoureuse de l'impact physiologique d'une altération de l'épissage alternatif spécifique à une tumeur est cruciale pour comprendre la contribution des isoformes d'épissage spécifiques à un type de cancer. Pour évaluer l'importance fonctionnelle de chacun des isoformes appartenant à des gènes reliés au cancer, des stratégies capables de diminuer l'abondance de ceux-ci d'une manière spécifique ou de reprogrammer la sélection du site d'épissage seront d'une importance capitale et pourront se révéler d'un grand intérêt au niveau clinique. Par exemple, débalancer le ratio d'isoformes en faveur du variant démontrant une activité dominante négative peut aider à renverser le phénotype tumoral des cellules cancéreuses.